Hello, I am running disvis with a single proteins against a ribosome. I am running locally as the run would not submit on the server (I imagine there is a residue limit there).
It works! once I renumber residues and edit chains.
However, when I do interaction analysis (hundreds of residues on the fixed chain and a few dozen on the scanning), the table returned only has a subset of the residues. Is there a limit there?
Here is my interaction residue list
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 203 204 206 208 209 210 211 212 213 214 215 292 378 381 382 383 385 386 387 419 420 421 422 423 541 542 543 544 545 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 658 659 660 661 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 789 790 791 792 793 794 795 796 797 798 799 800 801 802 803 804 805 806 807 808 809 810 811 812 813 814 815 816 817 818 819 820 821 822 823 824 826 827 828 829 830 831 832 833 839 840 841 842 844 845 846 847 848 849 850 851 852 853 855 856 858 859 860 861 862 863 865 866 867 868 869 870 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 1152 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196 1197 1198 1199 1200 1201 1202 1206 1207 1208 1209 1210 1211 1212 1213 1214 1215 1216 1217 1218 1219 1220 1221 1222 1223 1224 1225 1226 1227 1228 1229 1230 1231 1232 1233 1234 1235 1236 1237 1238 1239 1240 1241 1242 1243 1244 1245 1246 1247 1248 1249 1250 1251 1252 1253 1254 1255 1256 1257 1258 1259 1260 1261 1262 1263 1264 1265 1266 1267 1268 1269 1270 1271 1272 1273 1274 1275 1276 1277 1278 1279 1280 1281 1282 1283 1284 1285 1286 1287 1288 1289 1290 1291 1292 1293 1294 1295 1296 1297 1298 1299 1300 1301 1302 1303 1304 1305 1306 1307 1308 1309 1310 1311 1312 1313 1314 1315 1316 1317 1318 1319 1320 1321 1322 1323 1324 1325 1326 1327 1328 1329 1330 1331 1332 1333 1334 1335 1336 1337 1338 1339 1341 1342 1343 1344 1345 1346 1347 1348 1349 1350 1351 1353 1354 1355 1356 1357 1358 1359 1360 1361 1362 1363 1364 1365 1366 1367 1368 1369 1370 1371 1372 1373 1374 1375 1377 1378 1379 1380 1381 1382 1383 1384 1385 1386 1387 1388 1389 1390 1391 1392 1393 1394 1395 1396 1397 1398 1399 1400 1401 1402 1403 1404 1405 1406 1407 1408 1409 1410 1411 1412 1413 1414 1415 1416 1417 1418 1419 1420 1421 1422 1423 1424 1425 1426 1427 1428 1430 1431 1432 1433 1434 1435 1436 1437 1439 1440 1441 1442 1443 1444 1446 1447 1448 1449 1450 1451 1452 1453 1454 1455 1456 1457 1458 1459 1460 1461 1462 1463 1464 1465 1466 1467 1468 1469 1470 1471 1472 1473 1474 1475 1476 1477 1478 1479 1480 1481 1482 1483 1716 1717 1718 1719 1720 1721 1722 1724 1725 1732 1733 1734 1735 1736 1737 1738 1739 1740 1741 1742 1743 1744 1745 1746 1748 1749 1750 1751 1752 1753 1754 1755 1756 1757 1758 1759 1760 1761 1762 1763 1764 1765 1766 1767 1768 1769 1770 1771 1772 1773 1774 1775 1776 1777 1778 1779 1780 1781 1782 1783 1784 1785 1786 1787 1926 1927 1928 1929 2210 2211 2212 2213 2214 2215 2216 2217 2218 2219 2220 2221 2222 2223 2224 2225 2226 2233 2234 2235 2236 2237 2238 2239 2240 2241 2242 2243 2244 2245 2246 2247 2248 2249 2252 2253 2254 2256 2257 2258 2260 2261 2262 2263 2265 2266 2267 2268 2269 2270 2271 2272 2273 2284 2285 2286 2287 2310 2311 2312 2313 2314 2328 2340 2341 2342 2343 2344 2345 2346 2347 2348 2349 2351 2352 2353 2354 2355 2356 2357 2358 2370 2371 2372 2373 2374 2375 2376 2377 2378 2383 2384 2385 2386 2387 2388 2390 2391 2392 2393 2394 2395 2396 2397 2398 2399 2400 2401 2402 2403 2411 2412 2413 2414 2415 2416 2417 2418 2419 2420 2421 2432 2433 2434 2435 2436 2437 2438 2439 2440 2441 2442 2443 2452 2453 2454 2455 2456 2457 2458 2459 2460 2472 2473 2474 2475 2476 2477 2478 2479 2480 2481 2482 2483 2485 2486 2487 2488 2489 2490 2493 2501 2502 2503 2504 2505 2506 2507 2508 2509 2510 2511 2512 2529 2530 2531 2532 2533 2534 2535 2536 2537 2538 2539 2540 2541 2542 2543 2544 2545 2546 2547 2548 2549 2550 2551 2552 2553 2554 2555 2556 2557 2558 2559 2560 2561 2562 2563 2564 2565 2566 2567 2568 2569 2572 2604 2615 2616 2617 2618 2619 2620 2621 2622 2623 2624 2625 2626 2627 2628 2629 2630 2631 2632 2633 2634 2635 2636 2637 2638 2639 2640 2641 2642 2643 2644 2645 2646 2647 2648 2650 2651 2652 2653 2654 2660 2661 2662 2663 2664 2665 2666 2675 2676 2677 2678 2680 2681 2682 2683 2684 2685 2686 2687 2688 2689 2690 2691 2692 2693 2694 2695 2696 2697 2698 2699 4367 4368 4369 4370 4373 4374 4375 4376 4377 4378 4379 4380 4381 4382 4383 4386 4387 4388 4389 4390 4391 4392 4393 4395 4398 4400 4401 4403 4404 4407 4408 4409 4410 4411 4412 4413 4414 4415 4416 4417 4418 4419 4420 4421 4422 4423 4424 4425 4426 4427 4429 4430 4431 4432 4433 4434 4435 4436 4437 4438 4439 4440 4441 4442 4443 4444 4446 4447 4448 4449 4450 4451 4452 4453 4454 4455 4456 4457 4458 4459 4460 4461 4462 4463 4464 4465 4466 4467 4468 4469 4470 4471 4472 4474 4475 4476 4477 4478 4479 4480 4487 4488 4489 4490 4492 4493 4494 4495 4496 4497 4498 4499 4500 4501 4502 4503 4504 4505 4506 4507 4508 4509 4510 4511 4512 4513 4514 4515 4516 4517 4518 4519 4520 4521 4522 4523 4524 4525 4526 4527 4528 4529 4530 4531 4532 4533 4534 4535 4536 4537 4538 4539 4540 4541 4542 4543 4544 4545 4546 4547 4548 4549 4550 4551 4552 4553 4554 4555 4557 4558 4559 4560 4561 4562 4563 4564 4565 4566 4567 4568 4569 4570 4571 4572 4574 4575 4576 4577 4578 4579 4580 4581 4582 4583 4584 4585 4586 4587 4588 4589 4745 4746 4747 4748 4749 4750 4751 4752 4753 4754 4755 4756 4757 4758 4759 4760 4761 4762 4763 4764 4765 4766 4767 4768 4769 4771 4772 4773 4774 4775 4776 4777 4778 4779 4780 4781 4782 4783 4784 4785 4786 4787 4788 4790 4791 4792 4793 4794 4795 4796 4797 4798 4799 4800 4801 4802 4803 4804 4805 4806 4807 4808 4809 4810 4811 4812 4813 4814 4815 4816 4817 4818 4819 4820 4821 4822 4823 4824 4825 4826 4827 4828 4829 4830 4831 4832 4833 4834 4835 4836 4837 4838 4839 4840 4994 4995 4996 4997 4998 4999 5000 5001 5002 5003 5004 5005 5006 5007 5008 5009 5010 5011 5012 5013 5014 5015 5019 5021 5022 5023 5024 5025 5026 5027 5028 5029 5030 5031 5032 5033 5034 5035 5036 5038 5039 5040 5041 5042 5044 5045 5046 5047 5048 5049 5050 5051 5052 5053 5054 5055 5056 5057 5058 5059 5060 5061 5062 5063 5064 5065 5066 5067 5068 5069 5070 5071 5072 5073 5074 5075 5076 5077 5078 5079 5080 5081 5082 5083 5084 5085 5086 5087 5088 5089 5090 5091 5092 5093 5094 5095 5096 5097 5098 5099 5100 5101 5102 5103 5104 5105 5106 5107 5108 5109 5110 5111 5112 5113 5114 5115 5116 5124 5125 5130 5131 5132 5133 5134 5135 5143 5144 5145 5156 5171 5172 5173 5174 5175 5176 5177 5178 5179 5180 5181 5182 5183 5184 5185 5186 5187 5188 5189 5190 5191 5192 5193 5194 5195 5196 5197 5198 5199 5208 5210 5211 5212 5213 5214 5215 5216 5217 5218 5219 5220 5221 5222 5223 5224 5225 5226 5227 5228 5229 5230 5231 5232 5233 5258 5259 5261 5262 5263 5264 5265 5266 5267 5268 5269 5270 5271 5272 5279 5280 5282 5283 5284 5286 5287 5288 5289 5290 5291 5292 5293 5294 5296 5297 5298 5299 5300 5301 5302 5303 5304 5305 5306 5307 5308 5309 5310 5311 5315 5316 5317 5320 5323 5324 5325 5326 5327 5328 5329 5330 5331 5332 5333 5334 5335 5337 5339 5340 5341 5342 5343 5344 5345 5346 5347 5352 5353 5354 5355 5356 5357 5358 5359 5360 5361 5362 5363 5364 5365 5366 5367 5368 5369 5370 5371 5372 5373 5379 5380 5381 5382 5383 5384 5385 5386 5387 5388 5397 5406 5407 5408 5409 5410 5415 5416 5417 5418 5419 5420 5421 5422 5423 5424 5425 5426 5427 5428 5429 5430 5431 5441 5442 5443 5444 5445 5446 5447 5448 5449 5450 5451 5452 5453 5454 5455 5456 5457 5458 5459 5460 5461 5462 5463 5464 5465 5467 5470 5471 5472 5473 5474 5475 5476 5477 5478 5479 5480 5481 5482 5483 5484 5485 5486 5487 5488 5489 5491 5492 5493 5494 5495 5496 5497 5498 5499 5501 5502 5503 5504 5505 5506 5515 5516 5517 5518 5520 5521 5522 5523 5524 5525 5526 5527 5528 5529 5530 5531 5532 5533 5534 5535 5536 5537 5538 5539 5540 5541 5542 5543 5544 5545 5546 5547 5548 5549 5550 5551 5552 5553 5554 5555 5556 5557 5558 5559 5560 5561 5562 5563 5564 5565 5566 5567 5568 5569 5570 5571 5572 5573 5574 5575 5576 5577 5578 5579 5580 5581 5582 5583 5584 5585 5586 5587 5588 5589 5590 5591 5592 5593 5594 5595 5596 5597 5598 5599 5600 5601 5602 5603 5604 5605 5606 5607 5608 5609 5610 5611 5612 5613 5614 5615 5616 5617 5618 5619 5620 5621 5622 5623 5624 5625 5626 5627 5628 5629 5630 5631 5632 5633 5634 5635 5636 5639 5640 5641 5642 5643 5644 5645 5646 5652 5653 5654 5655 5665 5666 5668 5669 5670 5671 5673 5676 5677 5683 5697 5698 5699 5700 5701 5702 5703 5704 5708 5756 5757 5759 5760 5761 5762 5763 5764 5765 5766 5767 5768 5769 5770 5771 5772 5773 5774 5775 5776 5777 5778 5779 5780 5781 5782 5783 5784 5785 5786 5787 5788 5789 5790 5802 5803 5834 5835 5838 5873 5874 5876 5877 5880 5881 5931 5935 5940 5941 5942 5943 5944 5945 5946 5947 5949 5950 5951 5952 5953 5954 5955 5956 5957 5958 5959 5960 5961 5962 5963 5964 5965 5966 5967 5968 5969 5970 5971 5972 5973 5974 5975 5976 5977 5978 5979 5980 5981 5982 5983 5984 5985 5986 5987 5988 5989 5990 5991 5999 6000 6001 6002 6003 6004 6005 6006 6007 6008 6009 6010 6011 6016 6017 6018 6019 6020 6021 6022 6023 6024 6025 6026 6027 6028 6029 6030 6031 6032 6033 6034 6035 6057 6058 6059 6060 6061 6062 6085 6086 6087 6088 6099 6100 6101 6102 6103 6104 6131 6132 6133 6193 6196 6197 6198 6202 6203 6204 6205 6206 6207 6210 6211 6212 6213 6214 6215 6216 6217 6220 6221 6222 6227 6228 6229 6230 6231 6232 6235 6236 6237 6240 6241 6242 6243 6244 6245 6246 6247 6248 6249 6250 6251 6252 6254 6255 6257 6258 6259 6260 6261 6262 6263 6266 6269 6270 6271 6273 6274 6275 6276 6279 6284 6286 6287 6288 6289 6290 6291 6292 6293 6294 6295 6296 6297 6298 6299 6300 6301 6302 6303 6304 6305 6306 6308 6436 6437 6438 6441 6442 6443 6444 6445 6446 6447 6448 6449 6450 6451 6452 6453 6454 6455 6456 6457 6458 6459 6460 6461 6462 6463 6464 6465 6466 6467 6468 6469 6470 6471 6472 6473 6474 6475 6476 6477 6478 6479 6480 6481 6482 6483 6484 6485 6486 6487 6488 6489 6490 6491 6492 6493 6494 6495 6496 6497 6498 6499 6500 6501 6502 6503 6504 6505 6506 6507 6508 6509 6510 6511 6512 6513 6514 6515 6516 6517 6519 6520 6521 6522 6523 6524 6525 6526 6527 6528 6529 6530 6531 6532 6533 6534 6535 6536 6537 6538 6539 6543 6544 6545 6546 6547 6548 6549 6550 6551 6552 6553 6554 6555 6556 6557 6558 6559 6560 6561 6562 6563 6564 6565 6566 6567 6568 6569 6570 6571 6572 6574 6575 6576 6577 6578 6579 6580 6581 6582 6583 6584 6585 6586 6587 6588 6589 6590
21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 134
and the results table only has
#resi 24 25 26 27
21 0.000 0.000 0.000 0.000
22 0.000 0.000 0.000 0.000
23 0.000 0.000 0.000 0.000
24 0.000 0.000 0.000 0.000
25 0.000 0.000 0.000 0.000
26 0.000 0.000 0.000 0.000
27 0.000 0.000 0.000 0.000
28 0.000 0.000 0.000 0.000
29 0.000 0.000 0.000 0.000
30 0.000 0.000 0.000 0.000
31 0.000 0.000 0.000 0.000
32 0.000 0.000 0.000 0.000
33 0.000 0.000 0.000 0.000
34 0.000 0.000 0.000 0.000
…
6585 0.000 0.000 0.000 0.000
6586 0.000 0.000 0.000 0.000
6587 0.000 0.000 0.000 0.000
6588 0.000 0.000 0.000 0.000
6589 0.000 0.000 0.000 0.000
6590 0.000 0.000 0.000 0.000
and vice versa for receptor interactions. Am I missing something here? where are the rest of the ligand residues?